直通運行意解一列車原屬某路綫，行走部份或全部路段後，進入另一路綫行走。這種行走方法於日本十分常見（日文原文為「直通運転」，對應繁體中文寫法為「直通運轉」），有時更牽涉到3間公司的列車相互行走，但於香港並不常見。
香港直通運行的例子
港鐵路綫
- 觀塘綫及荃灣綫：當荃灣綫旺角以北段服務受阻，視情況而定，觀塘綫（油麻地方向）列車或會在旺角站過後直接駛入荃灣綫，改以中環為終點站。在某些時候，九龍灣車廠會派出列車由彩虹站2號及3號月台起載，直接以中環為終點站。
- 觀塘綫及將軍澳綫：視情況而定，觀塘綫（調景嶺方向）或會在油塘站過後直接駛入將軍澳綫，改以寶琳站為終點站並使用調景嶺站3號月台上落。[1]